.: Plante inferioare
.: Mamalogie
.: Ornitologie
.: Herpetologie
.: Plante vasculare
.: Entomologie
.: Geologie și paleontologie
.: Animale vii
Patrimoniul muzeal cuprinde în prezent un număr de 196.325 piese sistematizate în colecții de botanică, geologie, ihtiologie, malacologie, entomologie, herpetologie, ornitologie și paleontologie.
Colecțiile Muzeului de Științele Naturii sunt gestionate și valorificate din punct de vedere științific și expozițional de către muzeografii secției.
În cadrul colecțiilor domină piesele rezultate prin activitatea de cercetare științifică desfășurată de muzeografi în ecosisteme din județul Bacău, dar și din alte regiuni ale țării. Pe lângă acestea, colecții Muzeului de Științele Naturii mai cuprin piese obținute prin donații sau achiziții.
.: Malacologie