Colecția de herpetologie a fost inițiată în anii '60 și în prezent cuprinde 7056 de piese aparținând la 15 specii de amfibieni (5987 piese) și 16 specii de reptile (808 piese). Colecția include și 261 piese osteologice (cranii) de amfibieni. Piesele herpetologice sunt conservate în majoritate sub formă de preparate umede.
Această colecție este reprezentativă pentru fauna habitatelor din Moldova, prin numărul de specii de amfibieni și reptile pe care îl conservă.
.: Plante inferioare
.: Mamalogie
.: Ornitologie
.: Herpetologie
.: Entomologie
.: Geologie și paleontologie
.: Animale vii
.: Malacologie
.: Plante vasculare